近日,中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院北戴河中心實(shí)驗(yàn)站牙鲆遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在牙鲆無(wú)眼側(cè)黑化性狀研究方面取得新進(jìn)展,相關(guān)研究成果以“Identification candidate genes and loci associated with hypermelanosis of the blind side in Japanese flounder (Paralichthys olivaceus) using the combination of RNA-Seq and BSA-Seq”為題發(fā)表于《Aquaculture》(JCR 1區(qū)期刊,IF:3.9,全文網(wǎng)址為:https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2024.741583)。團(tuán)隊(duì)劉名揚(yáng)研究實(shí)習(xí)員、傘利擇研究實(shí)習(xí)員為第一作者,侯吉倫研究員、王桂興副研究員為通訊作者。

在牙鲆工廠化養(yǎng)殖過程中,無(wú)眼側(cè)皮膚黑化嚴(yán)重影響其經(jīng)濟(jì)價(jià)值。雌核發(fā)育作為一種可有效提升遺傳同質(zhì)性并固定特定性狀的技術(shù),被廣泛地應(yīng)用于魚類遺傳育種研究中。在本研究中,團(tuán)隊(duì)利用雌核發(fā)育技術(shù)制備了正常和無(wú)眼側(cè)皮膚黑化牙鲆的重組雙倍體群體,構(gòu)建了皮膚轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)和BSA-seq的分離池(Po_N和Po_H)。通過RNA-seq和BSA-seq相結(jié)合,篩選到5個(gè)InDel和3個(gè)SNP,經(jīng)204尾個(gè)體基因型驗(yàn)證和qRT-PCR實(shí)驗(yàn)證明候選基因ca4a和mreg中的3個(gè)位點(diǎn)與該性狀顯著相關(guān)。研究結(jié)果為解析牙鲆無(wú)眼側(cè)黑化的分子機(jī)制以及全白底板牙鲆的選育提供了重要的支撐。

本研究得到中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)(2023TD41)、河北省重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃(21326307D)、河北省自然科學(xué)基金(C2023107012)、國(guó)家海水魚產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-47)和國(guó)家海洋水產(chǎn)種質(zhì)資源庫(kù)等項(xiàng)目的資助。
(水產(chǎn)遺傳育種研究室 供稿)